У другій половині 2017 року Естонія вперше виступить в ролі голови Ради Європейського союзу. Це означає формування позицій Ради з урахуванням інтересів усіх 28 країн-членів, дотримуючись при цьому нейтральність. Країна – голова Ради змінюється кожні півроку. Естонія прийме естафету головування від Мальти, щоб через шість місяців в свою чергу передати її Болгарії.
Три головуючих поспіль країни домовляються між собою, яким сферам на європейському рівні приділяти більше уваги. Це забезпечує збереження важливих тем у фокусі 18 місяців поспіль. Естонія входить в одне тріо з Болгарією і Австрією. В обов’язки країни-голови входить організація засідань Ради ЄС та поточної діяльності робочих груп: складання повістки дня, керівництво всіма заходами, виявлення загальних моментів в ході дискусій. Дуже важливим аспектом є забезпечення співпраці з Європейським парламентом та Європейською комісією – особливо при вирішенні питань юридичного характеру.